论文初稿知网查重的方法有很多种。首先，可以通过知网等专业查重软件进行查重，查看论文与已有文献的相似度。其次，可以借助其他查重工具，如Turnitin等，进行多方面的检测。此外，还可以通过手工比对等方法，检测论文的原创性。总的来说，多种方法结合使用，可以更全面地检测论文的原创性。

在进行论文初稿知网查重时，需要注意一些问题。首先，要选择正规的查重软件，确保检测结果准确可靠。其次，要及时保存查重报告，作为论文原创性的证据。此外，在查重过程中，要注意保护个人隐私信息，避免信息泄露。最后，要认真分析查重结果，及时修改论文中存在的问题，确保论文的原创性和学术诚信。